После того, как Колсон помешал планам Гидры был назначен директором Щ.И.Т.'а. Ему приходится несладко, ведь большинство агентов либо убиты, либо покинули организацию, либо работают на Гидру. Мелинда Мэй продолжает работать в команде и присматривать за Колсоном, в котором проснулась неведомая сила, заставляющая его рисовать на стенах странные знаки. Гранд Уорд, как выяснилось ранее, является предателем и агентом Гидры. Фитц чудом избегает смерти на дне океана, но его мозгу нанесены серьезные повреждения, что сказывается на его когнитивных функциях. Джемма Симмонс на время покидает команду, так как у нее другое задание. Скай пытается оправиться от предательства Уорда и узнать тайну своего происхождения, ведь теперь она знает, что является «0-8-4», объектом неизвестного происхождения.